Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRTAC1Q9NQ79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CRTAC1Q9NQ79 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRTAC1Q9NQ79 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms