Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZCCHC17Q9NP64 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZCCHC17Q9NP64 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZCCHC17Q9NP64 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZCCHC17Q9NP64 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZCCHC17Q9NP64 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms