Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNA4Q9HCM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNA4Q9HCM2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXNA4Q9HCM2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXNA4Q9HCM2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLXNA4Q9HCM2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms