Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDFQ9HBH1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDFQ9HBH1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDFQ9HBH1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDFQ9HBH1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDFQ9HBH1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDFQ9HBH1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDFQ9HBH1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDFQ9HBH1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms