Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LY9Q9HBG7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LY9Q9HBG7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LY9Q9HBG7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LY9Q9HBG7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LY9Q9HBG7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LY9Q9HBG7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms