Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNCQ9H7C4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNCQ9H7C4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNCQ9H7C4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms