Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSS3Q9H6R3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSS3Q9H6R3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSS3Q9H6R3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSS3Q9H6R3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms