Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL31Q9H511 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL31Q9H511 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL31Q9H511 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL31Q9H511 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms