Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4G0

EPB41L1, Band 4.1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L1Q9H4G0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L1Q9H4G0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPB41L1Q9H4G0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41L1Q9H4G0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L1Q9H4G0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226 ms