Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MFSD1Q9H3U5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MFSD1Q9H3U5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MFSD1Q9H3U5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFSD1Q9H3U5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD1Q9H3U5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms