Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms