Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF39Q9H2S5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF39Q9H2S5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF39Q9H2S5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF39Q9H2S5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms