Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASSF4Q9H2L5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF4Q9H2L5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF4Q9H2L5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF4Q9H2L5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF4Q9H2L5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms