Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J7

SLC6A15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A15Q9H2J7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A15Q9H2J7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A15Q9H2J7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms