Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms