Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM117Q9H0C3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMEM117Q9H0C3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM117Q9H0C3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM117Q9H0C3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM117Q9H0C3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms