Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K7

STRADB, STE20-related kinase adapter protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBQ9C0K7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRADBQ9C0K7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRADBQ9C0K7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRADBQ9C0K7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADBQ9C0K7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms