Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BCL11BQ9C0K0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BCL11BQ9C0K0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
BCL11BQ9C0K0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BCL11BQ9C0K0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BCL11BQ9C0K0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms