Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR1Q9C0D0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHACTR1Q9C0D0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR1Q9C0D0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms