Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA4Q9BXL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA4Q9BXL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA4Q9BXL8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCA4Q9BXL8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms