Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SALL3Q9BXA9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SALL3Q9BXA9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SALL3Q9BXA9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SALL3Q9BXA9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SALL3Q9BXA9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms