Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM62Q9BVG3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM62Q9BVG3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM62Q9BVG3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM62Q9BVG3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM62Q9BVG3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms