Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDC1Q9BTX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC1Q9BTX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC1Q9BTX1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC1Q9BTX1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms