Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC1Q9BTT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC1Q9BTT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC1Q9BTT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms