Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM175Q9BSA9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM175Q9BSA9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM175Q9BSA9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM175Q9BSA9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM175Q9BSA9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms