Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH2D3AQ9BRG2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH2D3AQ9BRG2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SH2D3AQ9BRG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms