Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM7Q9BQ49 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM7Q9BQ49 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM7Q9BQ49 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM7Q9BQ49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms