Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CITED1Q99966 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CITED1Q99966 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms