Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MEIS3Q99687 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MEIS3Q99687 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MEIS3Q99687 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MEIS3Q99687 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MEIS3Q99687 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MEIS3Q99687 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms