Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUDCD1Q96RS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUDCD1Q96RS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCD1Q96RS6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms