Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLC4A9Q96Q91 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC4A9Q96Q91 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC4A9Q96Q91 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SLC4A9Q96Q91 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms