Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNC2Q96PR1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC2Q96PR1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC2Q96PR1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC2Q96PR1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms