Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms