Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAP1Q96NZ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAP1Q96NZ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAP1Q96NZ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAP1Q96NZ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAP1Q96NZ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAP1Q96NZ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAP1Q96NZ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAP1Q96NZ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAP1Q96NZ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAP1Q96NZ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAP1Q96NZ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms