Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JSRP1Q96MG2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JSRP1Q96MG2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JSRP1Q96MG2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms