Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL15Q96M94 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL15Q96M94 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KLHL15Q96M94 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL15Q96M94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms