Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALPK3Q96L96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ALPK3Q96L96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALPK3Q96L96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms