Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3IP1Q96FE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms