Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO17Q96EF6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO17Q96EF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms