Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRAMD1AQ96CP6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD1AQ96CP6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD1AQ96CP6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms