Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2FQ969M7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2FQ969M7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2171.8 ms