Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXTL1Q92935 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXTL1Q92935 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL1Q92935 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms