Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NEO1Q92859 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NEO1Q92859 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NEO1Q92859 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NEO1Q92859 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NEO1Q92859 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NEO1Q92859 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NEO1Q92859 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
NEO1Q92859 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEO1Q92859 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NEO1Q92859 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NEO1Q92859 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NEO1Q92859 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
NEO1Q92859 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms