Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR4A3Q92570 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR4A3Q92570 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR4A3Q92570 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms