Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWU5

TCP11, T-complex protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11Q8WWU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11Q8WWU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11Q8WWU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TCP11Q8WWU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCP11Q8WWU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11Q8WWU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11Q8WWU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11Q8WWU5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11Q8WWU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms