Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC44A1Q8WWI5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A1Q8WWI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A1Q8WWI5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC44A1Q8WWI5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms