Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC12Q8WUD4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC12Q8WUD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC12Q8WUD4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms