Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK1Q8TDC3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRSK1Q8TDC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRSK1Q8TDC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms