Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGARPQ8TDB4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MGARPQ8TDB4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MGARPQ8TDB4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGARPQ8TDB4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MGARPQ8TDB4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms