Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPPL3Q8TCT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPPL3Q8TCT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPPL3Q8TCT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPPL3Q8TCT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPPL3Q8TCT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms